一：在发酵开始时，切记不要选择腐烂变质或是带有毒性的秸秆，否则会抑制有益微生物菌株的繁殖，影响发酵质量。饲料的品质会非常差，甚至引起动物生病。注意蛋白和糖分的营养配比，才有利于微生物的生长繁殖。
二：水分问题：发酵饲料的微生物在生长时水分含量也很重要，由于各种原料的含水量不同，因此要加入不同的物质来调节水分含量，加水过多或者过少都会影响微生物的发酵，水分过多不利于散热，水分过少不利于微生物的生长。
三：重量问题： 发酵的秸秆在重量上也是有一定的要求，建议您不要少于30公斤，否则原料的量太少，不利于升温，达不到发酵的效果。
四：非常重要的：发酵中的通气问题：这个时候就需要用到发酵饲料袋，因为安装单向排气阀，能确保饲料袋内的无氧和无杂菌污染的环境，不仅能使微生物在包装袋内长期保持自然高活性，同时也保证了产品能长期储运。可以让饲料袋里的产品在发酵过程中产生的气体自动排出袋外，并阻隔外界空气进入袋内，防止饲料被氧化污染而发霉变质。巧妙地解决了微生物饲料发酵的散热、厌氧控制，以及包装、储运、稳定性等诸多问题。这个时候，就需要用到装有尧明单向排气阀的发酵袋。
五： 避光：发酵地点的选择也应该注意，别选在阳光直射的地方，以免紫外线的强射杀死发酵过程中的有益菌，造成其它杂菌的大量繁殖。
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